Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms