Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms