Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Rfc4-203ENSMUST00000115338 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 1700064H15Rik-201ENSMUST00000119133 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm14699-201ENSMUST00000122340 228 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Platr3-201ENSMUST00000146980 412 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm15699-201ENSMUST00000159213 280 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm5873-201ENSMUST00000177157 1066 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm29651-201ENSMUST00000189088 697 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 CAAA01125382.3-201ENSMUST00000215277 643 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Tcl1b1-202ENSMUST00000222342 664 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 AC107711.3-201ENSMUST00000228939 1035 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 1700095J12Rik-201ENSMUST00000124620 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm12273-201ENSMUST00000137418 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm16080-201ENSMUST00000152128 692 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm44917-201ENSMUST00000208798 520 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
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