Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Adar-203ENSMUST00000107405 5871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Tnik-201ENSMUST00000159236 12276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Ptpre-204ENSMUST00000209979 4959 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Zfat-204ENSMUST00000162054 4386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Dcc-201ENSMUST00000073379 4855 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Zc3hav1-203ENSMUST00000114900 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Myh15-201ENSMUST00000168680 6340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Arid5b-204ENSMUST00000219238 7581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm19410-201ENSMUST00000207505 6352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Stk36-201ENSMUST00000087183 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm19656-201ENSMUST00000208543 4610 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Ppfia1-202ENSMUST00000182226 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms