Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifnb1P01575 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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