Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms