Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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