Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Gm6880A3KG45 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Gm6880A3KG45 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
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Gm6880A3KG45 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Gm6880A3KG45 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Gm6880A3KG45 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6880A3KG45 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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