Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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PtprfA2A8L5 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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PtprfA2A8L5 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
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PtprfA2A8L5 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
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PtprfA2A8L5 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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PtprfA2A8L5 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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PtprfA2A8L5 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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PtprfA2A8L5 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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PtprfA2A8L5 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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PtprfA2A8L5 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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PtprfA2A8L5 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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PtprfA2A8L5 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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PtprfA2A8L5 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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PtprfA2A8L5 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprfA2A8L5 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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