Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Tomm5-203ENSMUST00000107809 738 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm14829-201ENSMUST00000121499 1138 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 AA623943-201ENSMUST00000121794 354 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm13781-201ENSMUST00000124153 492 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm13580-201ENSMUST00000131457 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 D430040D24Rik-201ENSMUST00000149224 910 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm26594-201ENSMUST00000180383 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Trav9n-1-201ENSMUST00000185224 339 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 B130024G19Rik-204ENSMUST00000191084 634 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Klk13-201ENSMUST00000066834 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Slc10a4-202ENSMUST00000201304 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Ifna5-201ENSMUST00000102804 570 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Ifna6-201ENSMUST00000105146 570 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm11929-201ENSMUST00000118175 945 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm8864-201ENSMUST00000118653 1010 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Pvalb-202ENSMUST00000120592 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Ptpa-210ENSMUST00000136009 810 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm13778-202ENSMUST00000146633 537 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm15831-201ENSMUST00000156195 516 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Ifna11-201ENSMUST00000170428 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm24368-201ENSMUST00000175388 106 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Fam240a-201ENSMUST00000177678 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 1700030N03Rik-206ENSMUST00000191405 651 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm5190-201ENSMUST00000192434 357 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Acsm5-204ENSMUST00000207387 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Olfr209-202ENSMUST00000208246 428 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm46329-201ENSMUST00000218373 609 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 AC134860.5-201ENSMUST00000225071 1249 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Phf5a-201ENSMUST00000023117 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Olfr1384-201ENSMUST00000060434 1034 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm25483-201ENSMUST00000083224 227 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Ifna1-201ENSMUST00000094972 570 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Igsf5-201ENSMUST00000000163 1851 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm45895-201ENSMUST00000212248 1697 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Fut8-202ENSMUST00000171770 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Rpain-202ENSMUST00000108529 282 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm12946-201ENSMUST00000122969 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm20483-201ENSMUST00000173162 851 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm23521-201ENSMUST00000177845 110 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm28916-201ENSMUST00000186988 699 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm37141-201ENSMUST00000191938 422 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm19566-201ENSMUST00000199576 610 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm18124-201ENSMUST00000210695 706 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 CT025689.5-201ENSMUST00000224316 986 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 318.9 ms