Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE7

Mesd, LRP chaperone MESD, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MesdQ9ERE7 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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MesdQ9ERE7 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms