Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Pik3c2g-209ENSMUST00000187618 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm6465-201ENSMUST00000168154 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm8871-202ENSMUST00000168945 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Malat1-203ENSMUST00000173499 485 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Smarca2-204ENSMUST00000175791 946 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Vmn1r-ps148-201ENSMUST00000176775 455 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 1500015L24Rik-202ENSMUST00000179640 780 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Snhg5-202ENSMUST00000182232 781 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm44404-201ENSMUST00000203979 636 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm18599-201ENSMUST00000206729 1125 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 AC153541.1-201ENSMUST00000213786 294 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm6362-201ENSMUST00000217686 836 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Olfr790-204ENSMUST00000218901 1070 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm34215-202ENSMUST00000223024 492 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 AC154329.2-201ENSMUST00000225257 383 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Vmn1r22-205ENSMUST00000228322 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Olfr790-201ENSMUST00000056002 1070 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm43165-201ENSMUST00000200842 1635 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm42455-201ENSMUST00000199761 2736 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Dtnbos-201ENSMUST00000173847 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Cylc1-202ENSMUST00000210720 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Sema6a-210ENSMUST00000156422 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Ighv1-20-201ENSMUST00000103506 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Ighv1-37-201ENSMUST00000103514 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Clec4a3-202ENSMUST00000117173 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm15094-201ENSMUST00000118394 1131 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm11798-201ENSMUST00000119150 421 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 5830468F06Rik-201ENSMUST00000184288 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm27332-201ENSMUST00000184893 112 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm37800-201ENSMUST00000192129 664 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms