Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn22Q9D7U6 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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