Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm36814-201ENSMUST00000197457 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nop56Q9D6Z1 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms