Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Odf2lQ9D478 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2lQ9D478 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2lQ9D478 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2lQ9D478 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2lQ9D478 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2lQ9D478 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2lQ9D478 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2lQ9D478 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2lQ9D478 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Odf2lQ9D478 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms