Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snx20Q9D2Y5 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snx20Q9D2Y5 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms