Protein–RNA interactions for Protein: Q9D162

Ccdc167, Coiled-coil domain-containing protein 167, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc167Q9D162 Slc24a1-201ENSMUST00000037798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Urb1-203ENSMUST00000140920 7344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Ehmt1-210ENSMUST00000147147 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Clic5-201ENSMUST00000024755 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Gm7967-202ENSMUST00000191042 5042 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc167Q9D162 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms