Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Use1Q9CQ56 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Use1Q9CQ56 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Use1Q9CQ56 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Use1Q9CQ56 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Use1Q9CQ56 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Use1Q9CQ56 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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