Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bhlhe41Q99PV5 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms