Protein–RNA interactions for Protein: Q99P87

Retn, Resistin, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetnQ99P87 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Abcc5-204ENSMUST00000115547 5372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Hcfc1-202ENSMUST00000114372 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Map1a-202ENSMUST00000110639 10145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Gpatch8-206ENSMUST00000143842 6871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Tanc1-203ENSMUST00000112568 7422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Nlrp12-201ENSMUST00000108653 6928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Pakap-203ENSMUST00000150412 5163 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Zfp532-208ENSMUST00000182852 5476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Zfhx3-201ENSMUST00000043896 16433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Smyd1-202ENSMUST00000114186 3292 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Lig3-211ENSMUST00000173722 5797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RetnQ99P87 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms