Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

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Length 1,463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Gm22582-201ENSMUST00000102283 94 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Gm15341-201ENSMUST00000137315 592 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Rarres2-203ENSMUST00000204182 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Rims1Q99NE5 Tdpoz4-201ENSMUST00000075953 1113 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 AC154197.1-201ENSMUST00000225136 1382 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Rims1Q99NE5 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Rims1Q99NE5 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Rims1Q99NE5 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Rims1Q99NE5 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Rims1Q99NE5 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 A930003A15Rik-201ENSMUST00000100083 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 Gm6426-201ENSMUST00000209048 854 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rims1Q99NE5 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms