Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms