Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 CT025645.2-201ENSMUST00000223278 3827 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm26797-202ENSMUST00000213132 2562 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms