Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
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