Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Gm7790-201ENSMUST00000118716 1310 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Slc31a2-202ENSMUST00000107467 868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Gm11929-201ENSMUST00000118175 945 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Gm8754-201ENSMUST00000118391 520 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Mir8104-201ENSMUST00000185165 101 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Gm18182-201ENSMUST00000191380 1251 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Gm2328-201ENSMUST00000193525 535 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Gm39147-202ENSMUST00000211730 882 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Gm34397-201ENSMUST00000213192 708 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Sparc-208ENSMUST00000214685 1269 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 4930458K08Rik-201ENSMUST00000219952 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 4933427E13Rik-201ENSMUST00000044347 381 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 3110001I22Rik-201ENSMUST00000035426 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Gm15720-201ENSMUST00000117133 282 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Olfr1060-ps1-201ENSMUST00000118335 943 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Gm15727-201ENSMUST00000122416 437 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Gm26021-201ENSMUST00000158664 131 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Vmn2r-ps13-201ENSMUST00000176920 606 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Gm9117-201ENSMUST00000177735 1098 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 AC132881.1-201ENSMUST00000223780 1062 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Eif3m-201ENSMUST00000028592 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Fdps-201ENSMUST00000081848 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Gm15650-201ENSMUST00000135451 770 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Gm16280-201ENSMUST00000162458 623 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Gm24466-201ENSMUST00000179978 109 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Gm26611-201ENSMUST00000181449 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Gm6946-201ENSMUST00000182237 987 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Gm18299-201ENSMUST00000192026 636 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 AC164978.2-201ENSMUST00000226645 857 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms