Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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