Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Htatsf1Q8BGC0 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms