Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Ttc29Q80VM3 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Ttc29Q80VM3 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
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