Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trak1Q6PD31 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms