Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
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Atg9bQ6EBV9 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Atg9bQ6EBV9 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Atg9bQ6EBV9 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Atg9bQ6EBV9 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Atg9bQ6EBV9 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Atg9bQ6EBV9 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Atg9bQ6EBV9 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Atg9bQ6EBV9 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Atg9bQ6EBV9 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Atg9bQ6EBV9 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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