Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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Xrcc1Q60596 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Xrcc1Q60596 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Xrcc1Q60596 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Xrcc1Q60596 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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Xrcc1Q60596 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Xrcc1Q60596 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Xrcc1Q60596 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Xrcc1Q60596 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Xrcc1Q60596 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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