Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf123Q5XPI3 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms