Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
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Usp48Q3V0C5 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Usp48Q3V0C5 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Usp48Q3V0C5 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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