Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Puf60Q3UEB3 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Puf60Q3UEB3 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms