Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q3U6N9 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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