Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 AC132384.2-201ENSMUST00000218018 526 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Nqo2-203ENSMUST00000220844 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 AC154433.1-201ENSMUST00000224401 1183 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 AC163638.2-201ENSMUST00000224920 827 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Pgk1-rs7-201ENSMUST00000085735 1255 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm15373-201ENSMUST00000121495 214 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 2410124H12Rik-201ENSMUST00000160494 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 1700019D03Rik-205ENSMUST00000190726 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Gm5190-201ENSMUST00000192434 357 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms