Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26815-201ENSMUST00000181200 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Bcas1-203ENSMUST00000109152 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Spocd1-201ENSMUST00000084263 3096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 5830473C10Rik-201ENSMUST00000094615 2308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Zscan21-202ENSMUST00000080732 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Tnfaip1-201ENSMUST00000017759 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Uox-201ENSMUST00000029837 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Fadd-201ENSMUST00000033394 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Xpnpep3-201ENSMUST00000041609 3236 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Ndst3-207ENSMUST00000172537 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm4810-201ENSMUST00000177721 1607 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnpk-216ENSMUST00000177019 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr63-201ENSMUST00000038920 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr1395-203ENSMUST00000214195 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr169-204ENSMUST00000216070 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Tmprss13-201ENSMUST00000034597 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38227-201ENSMUST00000193036 1602 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45797-201ENSMUST00000212759 1921 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Tbx4-202ENSMUST00000108045 2959 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Grb2-204ENSMUST00000106499 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 4631405J19Rik-202ENSMUST00000111270 2909 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Ankmy1-202ENSMUST00000160548 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr126-203ENSMUST00000217487 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm4784-201ENSMUST00000117365 1824 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap4-205ENSMUST00000114407 3051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Raf1-202ENSMUST00000112949 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Oc90-201ENSMUST00000060522 1909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms