Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Gm7340-201ENSMUST00000119729 2752 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Gm37593-201ENSMUST00000191669 3254 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cers3Q1A3B0 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 174 ms