Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Hspb11-202ENSMUST00000106749 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm13844-201ENSMUST00000134541 581 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm17134-201ENSMUST00000166593 437 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Timm21-201ENSMUST00000025547 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Rpusd2Q149F1 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Rpusd2Q149F1 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Rpusd2Q149F1 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Ptma-202ENSMUST00000186255 768 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Rpusd2Q149F1 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 AC160966.1-203ENSMUST00000214689 1186 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 AC140368.1-202ENSMUST00000226131 658 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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