Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Smok3c-202ENSMUST00000178402 1515 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Pbdc1-202ENSMUST00000119477 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Apela-201ENSMUST00000124790 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 8030423J24Rik-201ENSMUST00000022091 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 AC158519.1-201ENSMUST00000228615 179 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Cenph-201ENSMUST00000075550 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Cks2-201ENSMUST00000075853 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Coa4-202ENSMUST00000120454 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Cfap100-202ENSMUST00000127508 417 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Ube2i-214ENSMUST00000174216 1144 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Gm26913-201ENSMUST00000182391 732 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Gm8806-201ENSMUST00000120076 1407 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Gm23999-201ENSMUST00000158057 104 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Gm3383-203ENSMUST00000178414 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Gm3194-201ENSMUST00000180143 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Dcstamp-201ENSMUST00000022913 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Gm15539-201ENSMUST00000118452 566 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Gm12811-201ENSMUST00000125237 667 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Grip1os1-201ENSMUST00000126965 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Tex29-201ENSMUST00000033909 822 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Pigq-202ENSMUST00000097368 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Gm16268-201ENSMUST00000159445 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Olfr1511-201ENSMUST00000078171 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Ucma-202ENSMUST00000115010 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 A630023P12Rik-203ENSMUST00000141532 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TrioQ0KL02 Gm37012-201ENSMUST00000194991 1078 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms