Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Cntn3Q07409 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Cntn3Q07409 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
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Cntn3Q07409 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Cntn3Q07409 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Cntn3Q07409 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Cntn3Q07409 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Cntn3Q07409 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Cntn3Q07409 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cntn3Q07409 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cntn3Q07409 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cntn3Q07409 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cntn3Q07409 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cntn3Q07409 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntn3Q07409 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Cntn3Q07409 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntn3Q07409 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntn3Q07409 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntn3Q07409 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntn3Q07409 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntn3Q07409 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntn3Q07409 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntn3Q07409 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntn3Q07409 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntn3Q07409 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntn3Q07409 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntn3Q07409 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntn3Q07409 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntn3Q07409 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntn3Q07409 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntn3Q07409 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntn3Q07409 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntn3Q07409 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntn3Q07409 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntn3Q07409 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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