Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm12051-201ENSMUST00000147771 1341 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Apela-202ENSMUST00000142822 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 2900076A07Rik-203ENSMUST00000180879 725 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm43232-201ENSMUST00000201346 364 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm7972-201ENSMUST00000208434 1137 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 AC153936.1-201ENSMUST00000219874 395 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Dlx5-201ENSMUST00000052609 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm10997-201ENSMUST00000210294 1500 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Tpt1-ps5-201ENSMUST00000112150 516 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Oosp2-202ENSMUST00000135994 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 1700003G18Rik-202ENSMUST00000150518 312 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Malat1-202ENSMUST00000173314 556 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm37947-201ENSMUST00000192740 894 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm42948-201ENSMUST00000199085 578 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Vmn1r72-201ENSMUST00000053134 921 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Tatdn3-202ENSMUST00000085633 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm10307-201ENSMUST00000189839 1337 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm42467-201ENSMUST00000202954 1447 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Fgg-201ENSMUST00000048486 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms