Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme1P97371 2410124H12Rik-201ENSMUST00000160494 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme1P97371 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme1P97371 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm10842-201ENSMUST00000100338 369 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme1P97371 1700019D03Rik-205ENSMUST00000190726 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme1P97371 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme1P97371 4933407I05Rik-202ENSMUST00000213467 420 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme1P97371 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme1P97371 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm42687-201ENSMUST00000199075 164 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme1P97371 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme1P97371 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme1P97371 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme1P97371 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme1P97371 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psme1P97371 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms