Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Otx2P80206 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Otx2P80206 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Otx2P80206 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Otx2P80206 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Otx2P80206 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Otx2P80206 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Otx2P80206 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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