Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfi1P70338 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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