Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gp1bbP56400 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms