Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClgnP52194 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClgnP52194 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClgnP52194 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClgnP52194 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClgnP52194 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClgnP52194 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClgnP52194 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms