Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpdP50404 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpdP50404 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpdP50404 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpdP50404 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpdP50404 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms