Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grik2P39087 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Grik2P39087 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Grik2P39087 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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