Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp4P35123 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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